Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "Tjeerd Bouma (Royal Netherlands Institute for Sea 
2
  "author": "Tjeerd Bouma (Royal Netherlands Institute for Sea 
            
3
Research)",
3
Research)",
            
4
  "author_email": "tjeerd.bouma@nioz.nl",
4
  "author_email": "tjeerd.bouma@nioz.nl",
            
5
  "code": "7b.b.0j",
5
  "code": "7b.b.0j",
            
6
  "contributor": "Royal Netherlands Institute for Sea Research 
6
  "contributor": "Royal Netherlands Institute for Sea Research 
            
7
(NIOZ)",
7
(NIOZ)",
            
8
  "creator_user_id": "1b3d3614-6303-4f5e-b279-a4a8078670d1",
8
  "creator_user_id": "1b3d3614-6303-4f5e-b279-a4a8078670d1",
            
9
  "creators": 
9
  "creators": 
            
10
:\"Tjitske\",\"lastname\":\"Kooistra\",\"orcid\":\"0000-0003-2366-4099 
10
:\"Tjitske\",\"lastname\":\"Kooistra\",\"orcid\":\"0000-0003-2366-4099 
            
11
\",\"affiliation\":\"Royal Netherlands Institute for Sea 
11
\",\"affiliation\":\"Royal Netherlands Institute for Sea 
            
12
ingauthor\":false,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Tjitske 
12
ingauthor\":false,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Tjitske 
            
13
Kooistra - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
13
Kooistra - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
            
14
0000-0003-2366-4099 \"},{\"firstname\":\"Steven 
14
0000-0003-2366-4099 \"},{\"firstname\":\"Steven 
            
15
"Haarbosch\",\"orcid\":\"0009-0005-1845-5606\",\"affiliation\":\"Delft 
15
"Haarbosch\",\"orcid\":\"0009-0005-1845-5606\",\"affiliation\":\"Delft 
            
16
University of 
16
University of 
            
17
ndingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Steven 
17
ndingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Steven 
            
18
H. Haarbosch - Delft University of Technology - ORCID: 
18
H. Haarbosch - Delft University of Technology - ORCID: 
            
19
0009-0005-1845-5606\"},{\"firstname\":\"Jorn 
19
0009-0005-1845-5606\"},{\"firstname\":\"Jorn 
            
20
:\"Bosma\",\"orcid\":\"0000-0002-3275-3686\",\"affiliation\":\"Utrecht 
20
:\"Bosma\",\"orcid\":\"0000-0002-3275-3686\",\"affiliation\":\"Utrecht 
            
21
pondingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Jorn 
21
pondingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Jorn 
            
22
W. Bosma - Utrecht University - ORCID: 
22
W. Bosma - Utrecht University - ORCID: 
            
23
\":\"Bouma\",\"orcid\":\"0000-0001-7824-7546\",\"affiliation\":\"Royal 
23
\":\"Bouma\",\"orcid\":\"0000-0001-7824-7546\",\"affiliation\":\"Royal 
            
24
Netherlands Institute for Sea 
24
Netherlands Institute for Sea 
            
25
"contactemailaddress\":\"tjeerd.bouma@nioz.nl\",\"formatted\":\"Tjeerd 
25
"contactemailaddress\":\"tjeerd.bouma@nioz.nl\",\"formatted\":\"Tjeerd 
            
26
Bouma - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
26
Bouma - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
            
27
0000-0001-7824-7546 - Corresponding Author - 
27
0000-0001-7824-7546 - Corresponding Author - 
            
28
tjeerd.bouma@nioz.nl\"},{\"firstname\":\"Bram C.\",\"lastname\":\"van 
28
tjeerd.bouma@nioz.nl\"},{\"firstname\":\"Bram C.\",\"lastname\":\"van 
            
29
Prooijen\",\"orcid\":\"0000-0003-1375-1498\",\"affiliation\":\"Delft 
29
Prooijen\",\"orcid\":\"0000-0003-1375-1498\",\"affiliation\":\"Delft 
            
30
University of 
30
University of 
            
31
pondingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Bram 
31
pondingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Bram 
            
32
C. van Prooijen - Delft University of Technology - ORCID: 
32
C. van Prooijen - Delft University of Technology - ORCID: 
            
33
\"Soetaert\",\"orcid\":\"0000-0003-4603-7100\",\"affiliation\":\"Royal 
33
\"Soetaert\",\"orcid\":\"0000-0003-4603-7100\",\"affiliation\":\"Royal 
            
34
Netherlands Institute for Sea 
34
Netherlands Institute for Sea 
            
35
dingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Karline 
35
dingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Karline 
            
36
Soetaert - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
36
Soetaert - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
            
37
:\"Pearson\",\"orcid\":\"0000-0002-3986-4469\",\"affiliation\":\"Royal 
37
:\"Pearson\",\"orcid\":\"0000-0002-3986-4469\",\"affiliation\":\"Royal 
            
38
Netherlands Institute for Sea 
38
Netherlands Institute for Sea 
            
39
ndingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Stuart 
39
ndingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Stuart 
            
40
Pearson - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
40
Pearson - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
            
41
0000-0002-3986-4469\"}]",
41
0000-0002-3986-4469\"}]",
            
42
  "dataset_persistent_id": "DOI:10.25850/nioz/7b.b.0j",
42
  "dataset_persistent_id": "DOI:10.25850/nioz/7b.b.0j",
            
43
  "dates": 
43
  "dates": 
            
44
,\"type\":\"collected\",\"information\":null,\"formatted\":\"collected 
44
,\"type\":\"collected\",\"information\":null,\"formatted\":\"collected 
            
45
from: 15/08/2022 to: 15/08/2025 \"}]",
45
from: 15/08/2022 to: 15/08/2025 \"}]",
            
46
  "deposit_date": "2025-08-21",
46
  "deposit_date": "2025-08-21",
            
47
  "depositor": "Tjitske Kooistra (tjitske.kooistra@nioz.nl)",
47
  "depositor": "Tjitske Kooistra (tjitske.kooistra@nioz.nl)",
            
48
  "distribution_date": "2025-08-21",
48
  "distribution_date": "2025-08-21",
            
49
  "distributor": "Research Data Management(NIOZ Royal Netherlands 
49
  "distributor": "Research Data Management(NIOZ Royal Netherlands 
            
50
Institute for Sea Research)",
50
Institute for Sea Research)",
            
51
  "doi_date_published": "2025-11-13T11:04:43",
51
  "doi_date_published": "2025-11-13T11:04:43",
            
52
  "funding_references": 
52
  "funding_references": 
            
53
[{\"name\":\"NWO\",\"awardnumber\":\"17600\",\"awardtitle\":\"Tracking 
53
[{\"name\":\"NWO\",\"awardnumber\":\"17600\",\"awardtitle\":\"Tracking 
            
54
Ameland Inlet Living Lab Sediment (TRAILS)\",\"formatted\":\"NWO - 
54
Ameland Inlet Living Lab Sediment (TRAILS)\",\"formatted\":\"NWO - 
            
55
17600 - Tracking Ameland Inlet Living Lab Sediment 
55
17600 - Tracking Ameland Inlet Living Lab Sediment 
            
56
{\"name\":\"NWO\",\"awardnumber\":\"18035\",\"awardtitle\":\"Effective 
56
{\"name\":\"NWO\",\"awardnumber\":\"18035\",\"awardtitle\":\"Effective 
            
57
Upgrades and REtrofits for Coastal Climate Adaptation 
57
Upgrades and REtrofits for Coastal Climate Adaptation 
            
58
(EURECCA)\",\"formatted\":\"NWO - 18035 - Effective Upgrades and 
58
(EURECCA)\",\"formatted\":\"NWO - 18035 - Effective Upgrades and 
            
59
REtrofits for Coastal Climate Adaptation 
59
REtrofits for Coastal Climate Adaptation 
            
60
{\"name\":\"NWO\",\"awardnumber\":\"21026\",\"awardtitle\":\"Revealing 
60
{\"name\":\"NWO\",\"awardnumber\":\"21026\",\"awardtitle\":\"Revealing 
            
61
Hidden Networks of Coastal Sediment Pathways\",\"formatted\":\"NWO - 
61
Hidden Networks of Coastal Sediment Pathways\",\"formatted\":\"NWO - 
            
62
21026 - Revealing Hidden Networks of Coastal Sediment Pathways\"}]",
62
21026 - Revealing Hidden Networks of Coastal Sediment Pathways\"}]",
            
63
  "groups": [],
63
  "groups": [],
            
64
  "id": "be230bb7-ff26-4fe6-b784-a153dc9645fc",
64
  "id": "be230bb7-ff26-4fe6-b784-a153dc9645fc",
            
65
  "isopen": false,
65
  "isopen": false,
            
66
  "license_title": null,
66
  "license_title": null,
            
67
  "maintainer": "Tjitske",
67
  "maintainer": "Tjitske",
            
68
  "maintainer_email": "tjitske.kooistra@nioz.nl",
68
  "maintainer_email": "tjitske.kooistra@nioz.nl",
            
69
  "metadata_created": "2025-11-28T16:05:00.664833",
69
  "metadata_created": "2025-11-28T16:05:00.664833",
            
n
70
  "metadata_modified": "2025-11-28T16:05:00.664839",
n
70
  "metadata_modified": "2025-11-28T16:08:59.640766",
            
71
  "name": 
71
  "name": 
            
72
-different-shapes-affect-current-driven-sand-transport-data-and-code",
72
-different-shapes-affect-current-driven-sand-transport-data-and-code",
            
73
  "notes": "This dataset and code belongs to the manuscript \"How 
73
  "notes": "This dataset and code belongs to the manuscript \"How 
            
74
Shells of Different Shapes Affect Current-driven Sand Transport\". 
74
Shells of Different Shapes Affect Current-driven Sand Transport\". 
            
75
\n\nThe seabed rarely consists solely of bare sand: often other 
75
\n\nThe seabed rarely consists solely of bare sand: often other 
            
76
materials, such as shells are present. They can influence sand 
76
materials, such as shells are present. They can influence sand 
            
77
transport by armouring the bed and modifying its roughness. Biogenic 
77
transport by armouring the bed and modifying its roughness. Biogenic 
            
78
shells come in different shapes and sizes, depending on the mollusc 
78
shells come in different shapes and sizes, depending on the mollusc 
            
79
species that produce them. To understand how changes in bivalve 
79
species that produce them. To understand how changes in bivalve 
            
80
species composition affect sediment transport, we need a mechanistic 
80
species composition affect sediment transport, we need a mechanistic 
            
81
understanding of how shell content and shell shape influence the 
81
understanding of how shell content and shell shape influence the 
            
82
near-bed flow and sand transport. We performed experiments in a 
82
near-bed flow and sand transport. We performed experiments in a 
            
83
racetrack flume, testing the effect of elongated (Ensis leei) versus 
83
racetrack flume, testing the effect of elongated (Ensis leei) versus 
            
84
rounded (Spisula subtruncata) shells on unidirectional current-driven 
84
rounded (Spisula subtruncata) shells on unidirectional current-driven 
            
85
sand transport. For both types of shells, a higher depth-averaged flow 
85
sand transport. For both types of shells, a higher depth-averaged flow 
            
86
velocity was needed for initiation of motion and a decrease in bedload 
86
velocity was needed for initiation of motion and a decrease in bedload 
            
87
transport of sand was found. At a shell content of 20%, the threshold 
87
transport of sand was found. At a shell content of 20%, the threshold 
            
88
of motion of sand increased up to 75%, and bedload transport was 
88
of motion of sand increased up to 75%, and bedload transport was 
            
89
reduced by up to 50%. These effects are explained by a balance between 
89
reduced by up to 50%. These effects are explained by a balance between 
            
90
roughness-induced turbulence and bed armouring. Compared to a bare 
90
roughness-induced turbulence and bed armouring. Compared to a bare 
            
91
bed, shells decreased bed roughness by reducing ripple formation; 
91
bed, shells decreased bed roughness by reducing ripple formation; 
            
92
rounded shells lowered roughness more than elongated shells, which 
92
rounded shells lowered roughness more than elongated shells, which 
            
93
formed roughness elements themselves, but also covered a larger 
93
formed roughness elements themselves, but also covered a larger 
            
94
fraction of the bed. However, there was no clear difference between 
94
fraction of the bed. However, there was no clear difference between 
            
95
round versus elongated shells on the overall sand transport; only 
95
round versus elongated shells on the overall sand transport; only 
            
96
shell content was key for the overall effect. Our results imply that 
96
shell content was key for the overall effect. Our results imply that 
            
97
sediment transport is likely overpredicted when a high number of 
97
sediment transport is likely overpredicted when a high number of 
            
98
shells is present in the seabed.",
98
shells is present in the seabed.",
            
n
99
  "num_resources": 0,
n
99
  "num_resources": 1,
            
100
  "num_tags": 6,
100
  "num_tags": 6,
            
101
  "organization": {
101
  "organization": {
            
102
    "approval_status": "approved",
102
    "approval_status": "approved",
            
103
    "created": "2024-10-22T06:06:56.074257",
103
    "created": "2024-10-22T06:06:56.074257",
            
104
    "description": "",
104
    "description": "",
            
105
    "id": "bed2a893-3895-450b-bf4b-c74318003b1b",
105
    "id": "bed2a893-3895-450b-bf4b-c74318003b1b",
            
106
    "image_url": 
106
    "image_url": 
            
107
z.nl/application/files/1216/8924/5333/NIOZ-logo_witte_randi-2023.svg",
107
z.nl/application/files/1216/8924/5333/NIOZ-logo_witte_randi-2023.svg",
            
108
    "is_organization": true,
108
    "is_organization": true,
            
109
    "name": "nioz",
109
    "name": "nioz",
            
110
    "state": "active",
110
    "state": "active",
            
111
    "title": "Royal Netherlands Institute for Sea Research",
111
    "title": "Royal Netherlands Institute for Sea Research",
            
112
    "type": "organization"
112
    "type": "organization"
            
113
  },
113
  },
            
114
  "owner_org": "bed2a893-3895-450b-bf4b-c74318003b1b",
114
  "owner_org": "bed2a893-3895-450b-bf4b-c74318003b1b",
            
115
  "private": false,
115
  "private": false,
            
116
  "production_date": "2025-11-13",
116
  "production_date": "2025-11-13",
            
117
  "relationships_as_object": [],
117
  "relationships_as_object": [],
            
118
  "relationships_as_subject": [],
118
  "relationships_as_subject": [],
            
t
119
  "resources": [],
t
119
  "resources": [
            
120
    {
            
121
      "cache_last_updated": null,
            
122
      "cache_url": null,
            
123
      "created": "2025-11-28T16:08:59.661801",
            
124
      "datastore_active": false,
            
125
      "format": "ZIP",
            
126
      "hash": "",
            
127
      "id": "272489d5-1d48-4a52-8c55-ef8a0a5703cb",
            
128
      "last_modified": "2025-11-28T16:08:59.629835",
            
129
      "metadata_modified": "2025-11-28T16:08:59.647549",
            
130
      "mimetype": "application/zip",
            
131
      "mimetype_inner": null,
            
132
      "name": "DataProcessed.zip",
            
133
      "package_id": "be230bb7-ff26-4fe6-b784-a153dc9645fc",
            
134
      "position": 0,
            
135
      "resource_type": null,
            
136
      "size": 80024566,
            
137
      "state": "active",
            
138
      "url": 
            
139
urce/272489d5-1d48-4a52-8c55-ef8a0a5703cb/download/dataprocessed.zip",
            
140
      "url_type": "upload"
            
141
    }
            
142
  ],
            
120
  "state": "active",
143
  "state": "active",
            
121
  "subject": "Earth and Environmental Sciences",
144
  "subject": "Earth and Environmental Sciences",
            
122
  "tags": [
145
  "tags": [
            
123
    {
146
    {
            
124
      "display_name": "armouring",
147
      "display_name": "armouring",
            
125
      "id": "ca97da57-13c4-4f37-9fdd-25727890ce37",
148
      "id": "ca97da57-13c4-4f37-9fdd-25727890ce37",
            
126
      "name": "armouring",
149
      "name": "armouring",
            
127
      "state": "active",
150
      "state": "active",
            
128
      "vocabulary_id": null
151
      "vocabulary_id": null
            
129
    },
152
    },
            
130
    {
153
    {
            
131
      "display_name": "bed roughness",
154
      "display_name": "bed roughness",
            
132
      "id": "d87b0c61-0864-43e0-af7b-2979beb60d28",
155
      "id": "d87b0c61-0864-43e0-af7b-2979beb60d28",
            
133
      "name": "bed roughness",
156
      "name": "bed roughness",
            
134
      "state": "active",
157
      "state": "active",
            
135
      "vocabulary_id": null
158
      "vocabulary_id": null
            
136
    },
159
    },
            
137
    {
160
    {
            
138
      "display_name": "bioengineering",
161
      "display_name": "bioengineering",
            
139
      "id": "a33b11e6-4998-4325-aeb8-afb07d9380de",
162
      "id": "a33b11e6-4998-4325-aeb8-afb07d9380de",
            
140
      "name": "bioengineering",
163
      "name": "bioengineering",
            
141
      "state": "active",
164
      "state": "active",
            
142
      "vocabulary_id": null
165
      "vocabulary_id": null
            
143
    },
166
    },
            
144
    {
167
    {
            
145
      "display_name": "sediment transport",
168
      "display_name": "sediment transport",
            
146
      "id": "b839efe1-bc31-47ba-9acf-18898037b084",
169
      "id": "b839efe1-bc31-47ba-9acf-18898037b084",
            
147
      "name": "sediment transport",
170
      "name": "sediment transport",
            
148
      "state": "active",
171
      "state": "active",
            
149
      "vocabulary_id": null
172
      "vocabulary_id": null
            
150
    },
173
    },
            
151
    {
174
    {
            
152
      "display_name": "shells",
175
      "display_name": "shells",
            
153
      "id": "34806f35-38c9-40db-8aa4-3a3b8915838a",
176
      "id": "34806f35-38c9-40db-8aa4-3a3b8915838a",
            
154
      "name": "shells",
177
      "name": "shells",
            
155
      "state": "active",
178
      "state": "active",
            
156
      "vocabulary_id": null
179
      "vocabulary_id": null
            
157
    },
180
    },
            
158
    {
181
    {
            
159
      "display_name": "turbulence",
182
      "display_name": "turbulence",
            
160
      "id": "155aab36-2b41-40ef-a306-f22f88972cd9",
183
      "id": "155aab36-2b41-40ef-a306-f22f88972cd9",
            
161
      "name": "turbulence",
184
      "name": "turbulence",
            
162
      "state": "active",
185
      "state": "active",
            
163
      "vocabulary_id": null
186
      "vocabulary_id": null
            
164
    }
187
    }
            
165
  ],
188
  ],
            
166
  "title": "How Shells of Different Shapes Affect Current-driven Sand 
189
  "title": "How Shells of Different Shapes Affect Current-driven Sand 
            
167
Transport [data and code]",
190
Transport [data and code]",
            
168
  "type": "dataset",
191
  "type": "dataset",
            
169
  "url": "https://doi.org/10.25850/nioz/7b.b.0j",
192
  "url": "https://doi.org/10.25850/nioz/7b.b.0j",
            
170
  "version": "1"
193
  "version": "1"
            
171
}
194
}