Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": null,
2
  "author": null,
            
3
  "author_email": null,
3
  "author_email": null,
            
4
  "code": "7b.b.fd",
4
  "code": "7b.b.fd",
            
5
  "contributor": "NIOZ Royal Netherlands Institute for Sea Research",
5
  "contributor": "NIOZ Royal Netherlands Institute for Sea Research",
            
6
  "creator_user_id": "63e7592d-9651-4127-b7e7-e2d4a62f88a5",
6
  "creator_user_id": "63e7592d-9651-4127-b7e7-e2d4a62f88a5",
            
7
  "creators": "[{\"firstname\":\"Zo\u00eb\",\"lastname\":\"van 
7
  "creators": "[{\"firstname\":\"Zo\u00eb\",\"lastname\":\"van 
            
8
Kemenade\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal Netherlands 
8
Kemenade\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal Netherlands 
            
9
Institute for Sea 
9
Institute for Sea 
            
10
ctemailaddress\":\"zoe.van.kemenade@nioz.nl\",\"formatted\":\"Zo\u00eb 
10
ctemailaddress\":\"zoe.van.kemenade@nioz.nl\",\"formatted\":\"Zo\u00eb 
            
11
van Kemenade - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID:  
11
van Kemenade - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID:  
            
12
- Corresponding Author - 
12
- Corresponding Author - 
            
13
Anna\",\"lastname\":\"Cutmore\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal 
13
Anna\",\"lastname\":\"Cutmore\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal 
            
14
Netherlands Institute for Sea 
14
Netherlands Institute for Sea 
            
15
pondingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Anna 
15
pondingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Anna 
            
16
Cutmore - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
16
Cutmore - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
            
17
ick\",\"lastname\":\"Hennekam\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal 
17
ick\",\"lastname\":\"Hennekam\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal 
            
18
Netherlands Institute for Sea 
18
Netherlands Institute for Sea 
            
19
pondingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Rick 
19
pondingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Rick 
            
20
Hennekam - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
20
Hennekam - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
            
21
llen\",\"lastname\":\"Hopmans\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal 
21
llen\",\"lastname\":\"Hopmans\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal 
            
22
Netherlands Institute for Sea 
22
Netherlands Institute for Sea 
            
23
ondingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Ellen 
23
ondingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Ellen 
            
24
Hopmans - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
24
Hopmans - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
            
25
\"},{\"firstname\":\"Marcel\",\"lastname\":\"van der 
25
\"},{\"firstname\":\"Marcel\",\"lastname\":\"van der 
            
26
Meer\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal Netherlands Institute 
26
Meer\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal Netherlands Institute 
            
27
for Sea 
27
for Sea 
            
28
ndingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Marcel 
28
ndingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Marcel 
            
29
van der Meer - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
29
van der Meer - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
            
30
\"lastname\":\"Moijtahid\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"University 
30
\"lastname\":\"Moijtahid\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"University 
            
31
of 
31
of 
            
32
ndingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Meryem 
32
ndingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Meryem 
            
33
Moijtahid - University of Angers - ORCID: 
33
Moijtahid - University of Angers - ORCID: 
            
34
,\"lastname\":\"Jorissen\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"University 
34
,\"lastname\":\"Jorissen\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"University 
            
35
of 
35
of 
            
36
ondingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Frans 
36
ondingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Frans 
            
37
Jorissen - University of Angers - ORCID: 
37
Jorissen - University of Angers - ORCID: 
            
38
"Nicole\",\"lastname\":\"Bale\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal 
38
"Nicole\",\"lastname\":\"Bale\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal 
            
39
Netherlands Institute for Sea 
39
Netherlands Institute for Sea 
            
40
ndingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Nicole 
40
ndingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Nicole 
            
41
Bale - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
41
Bale - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
            
42
Jan\",\"lastname\":\"Reichart\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal 
42
Jan\",\"lastname\":\"Reichart\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal 
            
43
Netherlands Institute for Sea 
43
Netherlands Institute for Sea 
            
44
ingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Gert-Jan 
44
ingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Gert-Jan 
            
45
Reichart - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
45
Reichart - Royal Netherlands Institute for Sea Research - ORCID: 
            
46
\"},{\"firstname\":\"Jaap\",\"lastname\":\"Sinninghe 
46
\"},{\"firstname\":\"Jaap\",\"lastname\":\"Sinninghe 
            
47
Damst\u00e9\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal Netherlands 
47
Damst\u00e9\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal Netherlands 
            
48
Institute for Sea 
48
Institute for Sea 
            
49
pondingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Jaap 
49
pondingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null,\"formatted\":\"Jaap 
            
50
Sinninghe Damst\u00e9 - Royal Netherlands Institute for Sea Research - 
50
Sinninghe Damst\u00e9 - Royal Netherlands Institute for Sea Research - 
            
51
ORCID: 
51
ORCID: 
            
52
\"Darci\",\"lastname\":\"Rush\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal 
52
\"Darci\",\"lastname\":\"Rush\",\"orcid\":null,\"affiliation\":\"Royal 
            
53
Netherlands Institute for Sea 
53
Netherlands Institute for Sea 
            
54
arch\",\"iscorrespondingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null}]",
54
arch\",\"iscorrespondingauthor\":null,\"contactemailaddress\":null}]",
            
55
  "dataset_persistent_id": "DOI:10.25850/nioz/7b.b.fd",
55
  "dataset_persistent_id": "DOI:10.25850/nioz/7b.b.fd",
            
56
  "deposit_date": "2022-09-14",
56
  "deposit_date": "2022-09-14",
            
57
  "depositor": "Zoe van Kemenade",
57
  "depositor": "Zoe van Kemenade",
            
58
  "distribution_date": "2022-09-14",
58
  "distribution_date": "2022-09-14",
            
59
  "distributor": "Research Data Management(NIOZ Royal Netherlands 
59
  "distributor": "Research Data Management(NIOZ Royal Netherlands 
            
60
Institute for Sea Research)",
60
Institute for Sea Research)",
            
61
  "doi_date_published": "2023-03-15",
61
  "doi_date_published": "2023-03-15",
            
62
  "funding_references": "[{\"name\":\"Soehngen Institute of Anaerobic 
62
  "funding_references": "[{\"name\":\"Soehngen Institute of Anaerobic 
            
63
Microbiology 
63
Microbiology 
            
64
\",\"awardnumber\":\"024.002.002\",\"awardtitle\":\"Gravitation 
64
\",\"awardnumber\":\"024.002.002\",\"awardtitle\":\"Gravitation 
            
65
Grant\"}]",
65
Grant\"}]",
            
66
  "groups": [],
66
  "groups": [],
            
67
  "id": "1afab812-5d8f-445e-85d0-002ab17ba28e",
67
  "id": "1afab812-5d8f-445e-85d0-002ab17ba28e",
            
68
  "isopen": false,
68
  "isopen": false,
            
69
  "license_title": null,
69
  "license_title": null,
            
70
  "maintainer": null,
70
  "maintainer": null,
            
71
  "maintainer_email": null,
71
  "maintainer_email": null,
            
72
  "metadata_created": "2024-10-22T11:47:11.843489",
72
  "metadata_created": "2024-10-22T11:47:11.843489",
            
n
73
  "metadata_modified": "2024-10-22T17:12:22.600381",
n
73
  "metadata_modified": "2024-10-22T17:12:22.874274",
            
74
  "name": "7bbfd",
74
  "name": "7bbfd",
            
75
  "notes": "The eastern Mediterranean Sea (EMS) sedimentary record is 
75
  "notes": "The eastern Mediterranean Sea (EMS) sedimentary record is 
            
76
periodically interspersed with organic- rich \u2018sapropel\u2019 
76
periodically interspersed with organic- rich \u2018sapropel\u2019 
            
77
layers. Sapropels are characteristic of basin-wide anoxic events, 
77
layers. Sapropels are characteristic of basin-wide anoxic events, 
            
78
triggered by precession-forced insolation maxima. Relatively subdued 
78
triggered by precession-forced insolation maxima. Relatively subdued 
            
79
insolation maxima, however, are not always expressed as distinct 
79
insolation maxima, however, are not always expressed as distinct 
            
80
sapropel events. The EMS sedimentary record hereby allows anoxia and 
80
sapropel events. The EMS sedimentary record hereby allows anoxia and 
            
81
nitrogen (N) cycling tipping points to be investigated, which may act 
81
nitrogen (N) cycling tipping points to be investigated, which may act 
            
82
as analogues for modern deoxygenation. To this end, we investigated a 
82
as analogues for modern deoxygenation. To this end, we investigated a 
            
83
~68 kyr EMS sedimentary record, containing the well-established 
83
~68 kyr EMS sedimentary record, containing the well-established 
            
84
sapropel S1 (deposited in two phases: S1a [~10.5\u25008.5 ka BP] and 
84
sapropel S1 (deposited in two phases: S1a [~10.5\u25008.5 ka BP] and 
            
85
S1b [~7.8\u25006.1 ka BP]) and sediments timed to the ambiguous S2 
85
S1b [~7.8\u25006.1 ka BP]) and sediments timed to the ambiguous S2 
            
86
sapropel (~53 ka BP). We focus on lipid biomarkers of microorganisms 
86
sapropel (~53 ka BP). We focus on lipid biomarkers of microorganisms 
            
87
to reconstruct key components of the N cycle: (1) anaerobic ammonium 
87
to reconstruct key components of the N cycle: (1) anaerobic ammonium 
            
88
oxidation (anammox) using ladderanes and a stereoisomer of 
88
oxidation (anammox) using ladderanes and a stereoisomer of 
            
89
bacteriohopanetetrol (BHT-x), (2) dinitrogen gas (N2) fixation using 
89
bacteriohopanetetrol (BHT-x), (2) dinitrogen gas (N2) fixation using 
            
90
heterocyte glycolipids (HGs), and (3) nitrification by Thaumarchaeota 
90
heterocyte glycolipids (HGs), and (3) nitrification by Thaumarchaeota 
            
91
using crenarchaeol. During S1, export-productivity (indicated by the 
91
using crenarchaeol. During S1, export-productivity (indicated by the 
            
92
barium to aluminum ratio) and anoxia (indicated by redox-sensitive 
92
barium to aluminum ratio) and anoxia (indicated by redox-sensitive 
            
93
trace elements and benthic foraminifer assemblages) are enhanced. 
93
trace elements and benthic foraminifer assemblages) are enhanced. 
            
94
Thaumarchaeota are most abundant in S1a, while anammox is enhanced 
94
Thaumarchaeota are most abundant in S1a, while anammox is enhanced 
            
95
throughout S1. N2-fixation (indicated by bulk sedimentary \u03b415N) 
95
throughout S1. N2-fixation (indicated by bulk sedimentary \u03b415N) 
            
96
occurs throughout S1, while the highest heterocyte cyanobacteria 
96
occurs throughout S1, while the highest heterocyte cyanobacteria 
            
97
abundance is at the S1a termination and S1 interval. Ladderane 
97
abundance is at the S1a termination and S1 interval. Ladderane 
            
98
presence suggests additional episodes of bioavailable N removal 
98
presence suggests additional episodes of bioavailable N removal 
            
99
between ~69 to 39 cal ka BP. These episodes correspond to brief 
99
between ~69 to 39 cal ka BP. These episodes correspond to brief 
            
100
periods of water column deoxygenation, with anoxia occurring at the 
100
periods of water column deoxygenation, with anoxia occurring at the 
            
101
sediment-water interface in sediments timed to S2 (53\u250051 cal ka 
101
sediment-water interface in sediments timed to S2 (53\u250051 cal ka 
            
102
BP). During these episodes, ladderanes co-occur with the BHT-34R 
102
BP). During these episodes, ladderanes co-occur with the BHT-34R 
            
103
stereoisomer, but not BHT-x. Compound-specific \u03b413CBHT-34R 
103
stereoisomer, but not BHT-x. Compound-specific \u03b413CBHT-34R 
            
104
indicates an anammox source. Our results highlight various modes of 
104
indicates an anammox source. Our results highlight various modes of 
            
105
operation of the N cycle during the different deoxygenation events. 
105
operation of the N cycle during the different deoxygenation events. 
            
106
During S1a, a combination of N-loss and P-supply may have reinforced 
106
During S1a, a combination of N-loss and P-supply may have reinforced 
            
107
anoxia, by favoring diatom-diazotroph symbiotic consortia. Conversely, 
107
anoxia, by favoring diatom-diazotroph symbiotic consortia. Conversely, 
            
108
a coupling between N2-fixation and anammox was not observed during  
108
a coupling between N2-fixation and anammox was not observed during  
            
109
S1b and the S2-timed interval, either because loss of bioavailable N 
109
S1b and the S2-timed interval, either because loss of bioavailable N 
            
110
was insufficient or diazotrophs were nutrient limited. During these 
110
was insufficient or diazotrophs were nutrient limited. During these 
            
111
periods, anammox may have provided negative feedback on anoxia by 
111
periods, anammox may have provided negative feedback on anoxia by 
            
112
quenching primary production.",
112
quenching primary production.",
            
113
  "num_resources": 2,
113
  "num_resources": 2,
            
114
  "num_tags": 1,
114
  "num_tags": 1,
            
115
  "organization": {
115
  "organization": {
            
116
    "approval_status": "approved",
116
    "approval_status": "approved",
            
117
    "created": "2024-10-22T06:06:56.074257",
117
    "created": "2024-10-22T06:06:56.074257",
            
118
    "description": "",
118
    "description": "",
            
119
    "id": "bed2a893-3895-450b-bf4b-c74318003b1b",
119
    "id": "bed2a893-3895-450b-bf4b-c74318003b1b",
            
120
    "image_url": 
120
    "image_url": 
            
121
z.nl/application/files/1216/8924/5333/NIOZ-logo_witte_randi-2023.svg",
121
z.nl/application/files/1216/8924/5333/NIOZ-logo_witte_randi-2023.svg",
            
122
    "is_organization": true,
122
    "is_organization": true,
            
123
    "name": "nioz",
123
    "name": "nioz",
            
124
    "state": "active",
124
    "state": "active",
            
125
    "title": "Royal Netherlands Institute for Sea Research",
125
    "title": "Royal Netherlands Institute for Sea Research",
            
126
    "type": "organization"
126
    "type": "organization"
            
127
  },
127
  },
            
128
  "owner_org": "bed2a893-3895-450b-bf4b-c74318003b1b",
128
  "owner_org": "bed2a893-3895-450b-bf4b-c74318003b1b",
            
129
  "private": false,
129
  "private": false,
            
130
  "production_date": "2023-03-15",
130
  "production_date": "2023-03-15",
            
131
  "relationships_as_object": [],
131
  "relationships_as_object": [],
            
132
  "relationships_as_subject": [],
132
  "relationships_as_subject": [],
            
133
  "resources": [
133
  "resources": [
            
134
    {
134
    {
            
135
      "cache_last_updated": null,
135
      "cache_last_updated": null,
            
136
      "cache_url": null,
136
      "cache_url": null,
            
137
      "created": "2024-10-22T11:47:12.424822",
137
      "created": "2024-10-22T11:47:12.424822",
            
138
      "datastore_active": false,
138
      "datastore_active": false,
            
139
      "format": "XLSX",
139
      "format": "XLSX",
            
140
      "hash": "ad2bca96f3aedcf4715dff990892b59a",
140
      "hash": "ad2bca96f3aedcf4715dff990892b59a",
            
141
      "id": "c380ccc0-6198-4158-94f3-ffc9afbf1a79",
141
      "id": "c380ccc0-6198-4158-94f3-ffc9afbf1a79",
            
142
      "last_modified": "2024-10-22T11:47:12.405670",
142
      "last_modified": "2024-10-22T11:47:12.405670",
            
143
      "metadata_modified": "2024-10-22T11:47:12.862899",
143
      "metadata_modified": "2024-10-22T11:47:12.862899",
            
144
      "mimetype": 
144
      "mimetype": 
            
145
"application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet",
145
"application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet",
            
146
      "mimetype_inner": null,
146
      "mimetype_inner": null,
            
147
      "name": "Supplementary Material 2.xlsx",
147
      "name": "Supplementary Material 2.xlsx",
            
148
      "package_id": "1afab812-5d8f-445e-85d0-002ab17ba28e",
148
      "package_id": "1afab812-5d8f-445e-85d0-002ab17ba28e",
            
149
      "position": 0,
149
      "position": 0,
            
150
      "resource_type": null,
150
      "resource_type": null,
            
151
      "size": 35435,
151
      "size": 35435,
            
152
      "state": "active",
152
      "state": "active",
            
153
      "url": 
153
      "url": 
            
154
0-6198-4158-94f3-ffc9afbf1a79/download/supplementary-material-2.xlsx",
154
0-6198-4158-94f3-ffc9afbf1a79/download/supplementary-material-2.xlsx",
            
155
      "url_type": "upload"
155
      "url_type": "upload"
            
156
    },
156
    },
            
157
    {
157
    {
            
158
      "cache_last_updated": null,
158
      "cache_last_updated": null,
            
159
      "cache_url": null,
159
      "cache_url": null,
            
160
      "created": "2024-10-22T17:12:22.295256",
160
      "created": "2024-10-22T17:12:22.295256",
            
161
      "datastore_active": false,
161
      "datastore_active": false,
            
162
      "format": "PDF",
162
      "format": "PDF",
            
163
      "hash": "dcff0e97aaf41eeb4d1864c3bd39ca66",
163
      "hash": "dcff0e97aaf41eeb4d1864c3bd39ca66",
            
164
      "id": "8e1d8249-9917-4d2d-ab3c-d639d206630d",
164
      "id": "8e1d8249-9917-4d2d-ab3c-d639d206630d",
            
165
      "last_modified": "2024-10-22T17:12:22.274482",
165
      "last_modified": "2024-10-22T17:12:22.274482",
            
166
      "metadata_modified": "2024-10-22T17:12:22.606432",
166
      "metadata_modified": "2024-10-22T17:12:22.606432",
            
167
      "mimetype": "application/pdf",
167
      "mimetype": "application/pdf",
            
168
      "mimetype_inner": null,
168
      "mimetype_inner": null,
            
169
      "name": "Supplementary material 1.pdf",
169
      "name": "Supplementary material 1.pdf",
            
170
      "package_id": "1afab812-5d8f-445e-85d0-002ab17ba28e",
170
      "package_id": "1afab812-5d8f-445e-85d0-002ab17ba28e",
            
171
      "position": 1,
171
      "position": 1,
            
172
      "resource_type": null,
172
      "resource_type": null,
            
173
      "size": 1933044,
173
      "size": 1933044,
            
174
      "state": "active",
174
      "state": "active",
            
175
      "url": 
175
      "url": 
            
176
49-9917-4d2d-ab3c-d639d206630d/download/supplementary-material-1.pdf",
176
49-9917-4d2d-ab3c-d639d206630d/download/supplementary-material-1.pdf",
            
177
      "url_type": "upload"
177
      "url_type": "upload"
            
178
    }
178
    }
            
179
  ],
179
  ],
            
180
  "state": "active",
180
  "state": "active",
            
181
  "subject": "Earth and Environmental Sciences",
181
  "subject": "Earth and Environmental Sciences",
            
182
  "tags": [
182
  "tags": [
            
183
    {
183
    {
            
184
      "display_name": "Marine nitrogen cycle Sapropel Eastern 
184
      "display_name": "Marine nitrogen cycle Sapropel Eastern 
            
185
Mediterranean Sea Lipid biomarkers Anoxic events",
185
Mediterranean Sea Lipid biomarkers Anoxic events",
            
186
      "id": "51ff3a04-a5f0-4927-9a9c-5f77aafcfe0a",
186
      "id": "51ff3a04-a5f0-4927-9a9c-5f77aafcfe0a",
            
187
      "name": "Marine nitrogen cycle Sapropel Eastern Mediterranean 
187
      "name": "Marine nitrogen cycle Sapropel Eastern Mediterranean 
            
188
Sea Lipid biomarkers Anoxic events",
188
Sea Lipid biomarkers Anoxic events",
            
189
      "state": "active",
189
      "state": "active",
            
190
      "vocabulary_id": null
190
      "vocabulary_id": null
            
191
    }
191
    }
            
192
  ],
192
  ],
            
n
193
  "title": "Assessing marine nitrogen cycling dynamics under altering 
n
193
  "title": "Marine nitrogen cycling dynamics under altering redox 
            
194
redox conditions using depositions of sapropels S1 and the ambiguous 
194
conditions during depositions of sapropels S1 and the ambiguous S2 in 
            
195
S2 in the Eastern Mediterranean Sea",
195
the Eastern Mediterranean Sea",
            
196
  "type": "dataset",
196
  "type": "dataset",
            
197
  "url": "https://dataportal.nioz.nl/doi/10.25850/nioz/7b.b.fd",
197
  "url": "https://dataportal.nioz.nl/doi/10.25850/nioz/7b.b.fd",
            
t
198
  "version": "2"
t
198
  "version": "3"
            
199
}
199
}